图书文献信息中心前身为 1958 年成立的《福建中医药》杂志编辑室，现设有以收藏中医、中药和中西医结合研究类书刊为核心特色的专业性小型图书馆，馆内设有学习阅览室、中文图书库、中文期刊密集库、综合档案库，建筑面积约 500 平方米。目前馆藏文献近 3 万册，采用图书馆集成管理系统实现自动化、规范化管理。

中心在延续中医文献研究传统基础上，强化信息化管理与技术保障职能，建设完成福建省中医药古籍数字图书馆、福建省中医药综合统计信息平台等数字平台。在承担中医古籍整理、中医文献（理论）研究、福建历代医家学术经验挖掘整理等科研工作的同时，负责单位网络通信、内部系统运维等信息化相关工作。

中心先后编辑出版《福建中医医案医话》《福建中医临床经验汇编》《福建民间草药》《串雅外编选注》《集验背疽方》《中医急证文献》《福建省中医专家名录》等专著，在传承中医药文化、促进学术交流、支撑科研教学、保障单位信息化运行等方面发挥重要支撑作用，持续为福建省中医药医史文献研究与中医药信息化建设贡献力量。